Horreur ! Sherlock Holmes l’appelle "Étude en rouge", "parce que le fil rouge du meurtre se mêle à l’écheveau incolore de la vie".Il reste encore à Watson à découvrir un autre aspect, plus dérangeant, de son colocataire. "Je suis son homme", réplique Watson !La rencontre avec Sherlock Holmes, puisque c’est lui l’homme du laboratoire, a lieu l’après-midi au laboratoire de l’hôpital. C’est spectaculaire : le torrent, qui descend des Alpes bernoises, tombe par cinq cascades dont la plus impressionnante à 100 mètres de haut ! Peu après, Sherlock le mène à son enterrement de vie de garçon, John se mariant le lendemain avec Mary Morstan. Une fois sur place, Holmes et Watson découvrent que l'explosion servait surtout à camoufler l'assassinat d'un homme en particulier (Alfred Meinhart, le propriétaire d'une manufacture d'artillerie allemande), perpétrée par Moran au fusil de précision depuis le toit de l'Opéra. Holmes expérimente une nouvelle technique de camouflage urbain. Il est bon violoniste, il est adroit à la boxe et à l’escrime. Je m’arrange pour les mettre sur la voie. A ce moment, un groom vient chercher le docteur Watson et lui demande de revenir d’urgence à l’hôtel pour secourir une Anglaise au plus mal. Au bord du précipice, le sol est boueux, piétiné, ravagé. Holmes expérimente une nouvelle technique de camouflage urbain. De retour parmi les vivants, Holmes expose sa théorie à son ami et à la voyante : leur ennemi veut déclencher une guerre mondiale et en a largement les moyens financiers et matériels. Cela ne lui ressemble pas du tout, lui l’incarnation du flegme britannique.
Watson semble dubitatif devant ses explications : Sherlock veut jouer au chat et à la souris mais comment réussirait-il là où la police et même les gouvernements ont échoué ? Sherlock remet les rênes à Watson et va sur un balcon surplombant les C'est à ce moment que Sherlock explique à Moriarty qu'à l'heure où il lui parle, il l'a ruiné. L’abbé se métamorphose alors en quelques secondes : c’était un déguisement de Sherlock Holmes ! Il dit que depuis leurs dernières aventures, Holmes est plongé dans ce qui est la plus importante enquête de sa carrière, voire de tous les temps : arrêter le professeur James Moriarty. Acculé, tout le monde croyant qu'il est en fait un imposteur, Sherlock tente une dernière manœuvre. Mycroft ne peut les aider qu'en leur donnant une invitation pour le bal organisé à l'occasion de cette conférence. Ils découvrent alors que Moriarty a créé une fausse identité, Richard Brook, qui serait en fait un acteur engagé par Sherlock pour prétendre être un criminel, et participer à sa renommée. Irène va retrouver le professeur Moriarty dans un café rempli et lui avoue qu'elle n'est plus en possession de la fameuse lettre. Le lieu choisi n'est pas anodin : le détective est venu y rencontrer Après la cérémonie, un homme accoste Sherlock, le même homme qu'il avait repéré à la sortie de la salle des ventes juste avant de découvrir le cadavre du docteur Hoffmanstahl. Holmes lui explique qu’il fume un tabac très fort dans sa pipe. Celui-ci lui répond que c’est étrange, car le matin même il a rencontré un homme qui travaille au laboratoire de chimie de l’hôpital. Débarrassé de John, il contacte Molly à l'hôpital, et demande son aide. Elle leur avoue que son frère et elle faisaient partie d'un groupe d'Ils s'y dirigent donc rapidement, mais une fois sur place, Sherlock constate qu'il s'est fourvoyé et a suivi une fausse piste tracée par Moriarty. Laissons le nous l’expliquer :"Nous avons à Londres un tas de détectives relevant du gouvernement et des tas de détectives privés.
Chaque fois qu’il reçoit, il prie son colocataire de ne pas le déranger.Un jour mémorable, Watson se lève plus tôt que d’habitude et prend pour la première fois son petit-déjeuner avec Sherlock Holmes.
Pendant sa clandestinité, c’est Mycroft, son frère, qui avait subvenu à ses besoins. Holmes, réalisant son erreur, devine que la bombe explosera à l'hôtel du Triomphe, en face de l'Opéra, mais ils arrivent trop tard. Il semble terrorisé. Il rentre dans son salon qui est rempli de plantes tropicales et y trouve aussi une dinde, un perroquet et une chèvre. Ils doivent l'arrêter car il est la seule preuve contre Moriarty. Il refait surface au moment où l’assassinat de Sir Ronald Ader met Londres en émoi. L'épisode s'ouvre sur le premier rendez-vous de Watson avec sa psychologue depuis dix-huit mois. A propos, Lestrade est un excellent inspecteur de Scotland Yard. Il la rejoint à Kandahar, participe aux combats très violents. Les études du jeune Conan se feront dans des établissements religieux : une école préparatoire dans le Lancashire, puis le Collège de Stonyhurst. Il offre ce nouveau remède miracle à Watson comme cadeau de mariage. Une fois sur place, Holmes et Watson découvrent que l'explosion servait surtout à camoufler l'assassinat d'un homme en particulier (Alfred Meinhart, le propriétaire d'une manufacture d'artillerie allemande), perpétrée par Moran au fusil de précision depuis le toit de l'Opéra. Apparemment, la nouvelle avait été publiée dans Le Journal de Genève du 6 mai 1891 puis dans la presse britannique du 7 mai, grâce à une dépêche de l’Agence Reuters. Il adore la musique. Il est remonté jusqu'à lui à la suite de toute une série de meurtres et d'attaques terroristes. L’infirmier lui présente Watson auquel il dit : "Vous avez été en Afghanistan à ce que vois".
Moriarty le poursuit, et les deux hommes tombent dans les chutes du Reichenbach près de Meiringen, en Suisse, au cours de leur duel final. Pendant ce temps, Holmes entre dans la fabrique et est capturé par Moriarty qui le torture, toujours sur son air préféré de Plus tard, Sherlock, extrêmement affaibli, rend l'âme dans le wagon.